125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5617 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5617  flavin-containing amine oxidase  100 
 
 		 432 aa  895    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  35.24 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  33.17 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1555  amine oxidase  34.61 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.5068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  33.81 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2437  amine oxidase  34.57 
 
 		 424 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  32.45 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  31.65 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2253  amine oxidase  32.37 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  33.57 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  32.37 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1616  amine oxidase  34.45 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1118  amine oxidase, flavin-containing protein  31.18 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  33.57 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0088  amine oxidase flavin-containing  34.86 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  31.89 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01433  putative dehydrogenase  31.57 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.923495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1956  amine oxidase  33.02 
 
 		 425 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  32.37 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  33.49 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1482  amine oxidase  33.02 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  32.61 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  32.86 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  32.86 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  34.2 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  32.86 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  31.33 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  32.3 
 
 		 445 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0814  hypothetical protein  32.37 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0350  amine oxidase  33.18 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  34.75 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  34.34 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  34.5 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  31.83 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1489  amine oxidase  31.08 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  33.96 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  31.49 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  31.75 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  32.3 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2025  amine oxidase  33.33 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  33.56 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  32.06 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  31.1 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3370  amine oxidase  31.28 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 434 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  32.37 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 430 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  32.3 
 
 		 415 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3583  amine oxidase  33.41 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  32.61 
 
 		 667 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3033  amine oxidase  31.03 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.567673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0298  amine oxidase  32.08 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1622  amine oxidase  33.33 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  32.13 
 
 		 449 aa  202  7e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4842  amine oxidase  31.75 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.265562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 570 aa  202  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  33.64 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  31.65 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1177  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  32.56 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10455  hypothetical protein  32.95 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  30.88 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  33.18 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1443  amine oxidase  32.46 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  33.18 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0723  amine oxidase  31.1 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.885481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  29.38 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3930  hypothetical protein  30.28 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  32.64 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  28.97 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  32.14 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0236  putative dehydrogenase  31.66 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2567  amine oxidase  30.63 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5886  amine oxidase  32.34 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2904  amine oxidase  31.18 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  31.04 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2327  hypothetical protein  30.66 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  29.28 
 
 		 570 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1239  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0355742  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2840  amine oxidase  30.28 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1053  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2556  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0108905  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1802  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000561447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  30.05 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0911  amine oxidase  31.92 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6096  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0754929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1176  amine oxidase  27.13 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0490  amine oxidase:FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.599363  normal  0.908175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0462  amine oxidase  31 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0414  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308842  normal  0.291599 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  29.72 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  27.07 
 
 		 462 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0102  amine oxidase  29.93 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1867  amine oxidase  27.27 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>