More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4210 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 180 aa  347  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  91.72 
 
 		 177 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  89.66 
 
 		 183 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  88.28 
 
 		 184 aa  267  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  83.57 
 
 		 166 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  80.17 
 
 		 140 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  75.41 
 
 		 126 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  77.87 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  75.41 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  77.87 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  76.72 
 
 		 127 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  76.67 
 
 		 148 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  77.97 
 
 		 132 aa  193  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  77.05 
 
 		 145 aa  193  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  76.72 
 
 		 131 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  78.45 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  71.2 
 
 		 131 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  76.27 
 
 		 134 aa  190  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  76.27 
 
 		 134 aa  190  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  71.2 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  71.2 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  77.59 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  75 
 
 		 129 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  69.11 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  68.66 
 
 		 131 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  72.87 
 
 		 146 aa  187  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  69.53 
 
 		 131 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  68.03 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  73.28 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 124 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 126 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 124 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  64.8 
 
 		 127 aa  161  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 125 aa  157  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  63.71 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 128 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 135 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  65.25 
 
 		 117 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 128 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  64.46 
 
 		 126 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 118 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  59.56 
 
 		 130 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  61.79 
 
 		 127 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 113 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  61.79 
 
 		 127 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  60.98 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 114 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  61.79 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  59.7 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  60.16 
 
 		 146 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 118 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 123 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 126 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  60.98 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  60.98 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  58.09 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  58.09 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  58.09 
 
 		 130 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 115 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 114 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  58.87 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  61.16 
 
 		 129 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  60.16 
 
 		 131 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  59.02 
 
 		 121 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  62.9 
 
 		 127 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  60.5 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  62.6 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  60.16 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  55.28 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  60.5 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>