45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3990 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  51.7 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  44.37 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  34.45 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  30.98 
 
 		 474 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  27.89 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  27.49 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  27.15 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  27.15 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  26.8 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  27.49 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  30.58 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  29.15 
 
 		 534 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  28.79 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  29.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  27.7 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  26.19 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  28.04 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  25.64 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  28.42 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  25.38 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  27.05 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  27.1 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  27.41 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  26.28 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  27.95 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  23.44 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  26.06 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  24.35 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  31.43 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>