38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3728 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  813    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  49.63 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  50.27 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  47.03 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  42.21 
 
 		 416 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  44.1 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  44.1 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  45.27 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  37.59 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  34.75 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  41.71 
 
 		 485 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  37.96 
 
 		 480 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  32.25 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  38.16 
 
 		 481 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  38.05 
 
 		 485 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  38.05 
 
 		 485 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  29.53 
 
 		 540 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  37.09 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  31.29 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  29.85 
 
 		 565 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  34.72 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  33.77 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  36.11 
 
 		 547 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  36.62 
 
 		 561 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  30.38 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  29.67 
 
 		 349 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  28.72 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  23.97 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  27.49 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  27.49 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  26.54 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  28.72 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  24.18 
 
 		 352 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  23.83 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  28.37 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  28.57 
 
 		 201 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  28.17 
 
 		 201 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>