29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3394 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3394  divalent cation transporter  100 
 
 		 271 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1640  F protein (gpF) (protein GP30)  45.4 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3394  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  48.24 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2100  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  45.76 
 
 		 405 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.135098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1300  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  45.76 
 
 		 405 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4501  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  37.56 
 
 		 572 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1878  SPP1 family phage head morphogenesis protein  34.09 
 
 		 458 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0672  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  32.18 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.638572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0730  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  32.42 
 
 		 417 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3374  Phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  33.33 
 
 		 426 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2927  prophage MuMc02, F protein precursor  32.97 
 
 		 765 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1285  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  35.33 
 
 		 433 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61142e-29 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0264  putative prophage MuSo1, F protein  36.6 
 
 		 406 aa  92.4  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3784  phage putative head morphogenesis protein, SPP1 gp7  29.35 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0668  prophage MuSo1, F protein, putative  30.77 
 
 		 445 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2090  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.69 
 
 		 437 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2137  SPP1 family phage head morphogenesis protein  28.69 
 
 		 439 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.232277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1913  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  27.51 
 
 		 390 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2681  prophage MuSo2, F protein, putative  27.22 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1967  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  29.94 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.391053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0762  F protein  28.33 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0675  F protein  28.33 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0434  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  27.27 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0251  prophage MuSo1, F protein, putative  27.57 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00526312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2247  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  31.76 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3005  prophage MuSo2 F protein  24.86 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.680604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3904  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  22.99 
 
 		 728 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1260  phage head morphogenesis protein, SPP1 gp7 family  21.39 
 
 		 729 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1003  putative phagehead morphogenesis protein, SPP1 gp7  30.5 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>