15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2760 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1106    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  47.66 
 
 		 1573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  40.54 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  34.51 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  34.78 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  33.65 
 
 		 180 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  42.27 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1461 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  35.05 
 
 		 118 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  32.06 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  34.34 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>