More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2678 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  227  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  71.82 
 
 
110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.48 
 
 
116 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  71.82 
 
 
110 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  70.48 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  70.48 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.48 
 
 
108 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  59.09 
 
 
110 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  59.09 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  58.18 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  58.18 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.16 
 
 
109 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.21 
 
 
107 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  61.17 
 
 
113 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.36 
 
 
110 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.9 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
108 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
108 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  54.63 
 
 
109 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.45 
 
 
110 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.21 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.32 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.63 
 
 
109 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.07 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
141 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.37 
 
 
108 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  44.14 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
121 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.4 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  53.4 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.51 
 
 
115 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  45.05 
 
 
116 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
116 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48 
 
 
128 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.54 
 
 
120 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
132 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
130 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  46.36 
 
 
116 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.24 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.24 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.24 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.07 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.1 
 
 
116 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  47.06 
 
 
117 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  47.79 
 
 
122 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  46.46 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.86 
 
 
114 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.86 
 
 
114 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
114 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
114 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  43.4 
 
 
113 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.86 
 
 
114 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
116 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1044  HesB/YadR/YfhF  48.48 
 
 
116 aa  104  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0515022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
121 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
113 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  50.49 
 
 
109 aa  103  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
116 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.37 
 
 
116 aa  103  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45 
 
 
115 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.51 
 
 
111 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
120 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.46 
 
 
114 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
122 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45 
 
 
115 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.46 
 
 
114 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  50.54 
 
 
124 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
124 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
116 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
118 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
116 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
123 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.73 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  45.71 
 
 
121 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.69 
 
 
120 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.44 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
110 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.28 
 
 
113 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43 
 
 
114 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.46 
 
 
113 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43 
 
 
114 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0843  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.86 
 
 
116 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>