65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2477 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2477  exported protein  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  42.19 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  37.4 
 
 		 293 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  37.4 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  35.69 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  39.13 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  42.97 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  36.82 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  36.19 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  33.21 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  36.12 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  34.1 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.3 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  34.13 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  34 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  28.76 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.6 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.74 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  28.86 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  26.64 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  30.45 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.66 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  28.27 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  26.94 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  24.37 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  25.82 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.86 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  23.81 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.76 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  25.1 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3786  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.295357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  24.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  26.29 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.08 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 340 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0942  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0652855  normal  0.381593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2268  metallo beta lactamase superfamily protein  24.61 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1769  metal-dependent hydrolase  23.2 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2229  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3315  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  23.81 
 
 		 366 aa  45.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  25.41 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1920  beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  23.77 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  27.33 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2788  UPF0173 metal-dependent hydrolase  22.8 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0574  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.087898  normal  0.169456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  23.78 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  25.99 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  25.9 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2407  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000667891  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  23.68 
 
 		 440 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  22.9 
 
 		 324 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 		 227 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.54 
 
 		 362 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>