17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1392 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  844    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1402  hypothetical protein  47.45 
 
 
419 aa  361  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0903793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  39.51 
 
 
408 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1103  hypothetical protein  26.77 
 
 
408 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0564  hypothetical protein  24.62 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  21.18 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  21.6 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  21.6 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  22.56 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  22.56 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  38.78 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  25.76 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  34.48 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  29.23 
 
 
806 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  30 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.884235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>