26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1469 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  55.36 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07340  hypothetical protein  49.06 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.271335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  41.8 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1507  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0341474  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  35.04 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  35.25 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.46 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 116 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  37.72 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  32.32 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10630  LysM domain-containing protein  34.31 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1055  Peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.62 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1809  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.31 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0414722  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 104 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  27.38 
 
 		 120 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  38.61 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0573  LysM domain protein  35.71 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0448412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.46 
 
 		 203 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  34.04 
 
 		 95 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>