163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0952 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 353 aa  735    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  35.78 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  32.05 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  33.91 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  32.25 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  32.35 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  31.45 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  30.86 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  31.16 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  31.36 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  31.16 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  30.86 
 
 		 349 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  30.86 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  30.86 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  30.86 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  30.56 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  30.56 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  29.33 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  29.33 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  30.81 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  31.03 
 
 		 399 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  31.59 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  31.59 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  31.59 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  32.46 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  31.88 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  28.7 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  31.01 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  27.76 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  28.29 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  29.86 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  31.88 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  30.14 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  27.41 
 
 		 394 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  27.11 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  29.57 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  29.75 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  27.78 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  26.67 
 
 		 392 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  28.21 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  24.64 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  27.03 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  26.45 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  27.38 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  26.38 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1120  cellulase  27.72 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  30.3 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  27.55 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  28.4 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  27.87 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  25.44 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  28.19 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  27.59 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  26.12 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  26.18 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  29.36 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  24.66 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  25.73 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  26.58 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  29.17 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  25.24 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  27.34 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  23.25 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  23.65 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0599  peptidase M42 family protein  27.81 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000044001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3132  hypothetical protein  25.81 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0428  peptidase, M42 family  23.85 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  23.85 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4808  peptidase, M42 family  23.85 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  23.85 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4527  glutamyl aminopeptidase  23.39 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  23.39 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  23.39 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  23.39 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  27.14 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  24.79 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  23.39 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  23.39 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  24.81 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  25.48 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  24.44 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  26.75 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  29.63 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  26.27 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3752  peptidase M42 family protein  23.93 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1827  glutamyl-aminopeptidase  25.56 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00222844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  26.78 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  22.48 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  22.69 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  25.85 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  23.85 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  24.19 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  24.9 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  26.19 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  22.19 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  25.78 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  26.05 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  24.44 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  22.55 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  24.77 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>