More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0625 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0625  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 474 aa  966    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.59 
 
 		 433 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.3 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.24 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.37 
 
 		 433 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.09 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.22 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.94 
 
 		 433 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  29.78 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  33.82 
 
 		 526 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  28.57 
 
 		 429 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  34.07 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 		 452 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  33.03 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  31.1 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  31.56 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  32.25 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.42 
 
 		 470 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  31.63 
 
 		 437 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  30.97 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  31.17 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  31.03 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.07 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  30.45 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  32.73 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  32.82 
 
 		 515 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  30.87 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.59 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  26.96 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  33.5 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  30.94 
 
 		 424 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  28.7 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  32.64 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  32.76 
 
 		 452 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.48 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  28.08 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  31.45 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  27.31 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  27.93 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  28.39 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  30.74 
 
 		 424 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.04 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  30.34 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  29.71 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  29.72 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  30.75 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  30.43 
 
 		 847 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.4 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.99 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  26.62 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  29.95 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  31.6 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  30.34 
 
 		 813 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  32.39 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.75 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  30.43 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  29.26 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  32.7 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  29.76 
 
 		 422 aa  154  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  30.98 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.38 
 
 		 462 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  32.44 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  28.12 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  29.28 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  29.37 
 
 		 817 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  30.58 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  29.33 
 
 		 407 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  31.34 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  30.25 
 
 		 543 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  30.14 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.14 
 
 		 422 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  32.79 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  31.26 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  30.34 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  28.75 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  28.22 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  27.12 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.73 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  30.93 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.3 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  28.83 
 
 		 425 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  29.53 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  31.62 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  31.13 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  26.91 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  27.95 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  26.88 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>