25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0039 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  365  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  47.65 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  46.11 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  40.36 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  45.68 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  44 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  42.48 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  35.98 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  30.56 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  30.57 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.45 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  28.37 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  32.19 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  30.56 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  29.94 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  27.46 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  25 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  27.43 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  26.57 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>