28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1841 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  100 
 
 
314 aa  642    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  31.28 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  27.55 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  36.15 
 
 
144 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  33.59 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  39.78 
 
 
155 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  24.7 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  33.91 
 
 
165 aa  67  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  25.53 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  32.67 
 
 
147 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  26.62 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2461  hypothetical protein  23.53 
 
 
435 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  27.74 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0117  putative lipoprotein  24.55 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.19 
 
 
157 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.71 
 
 
600 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  30.12 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  30.09 
 
 
611 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  26.79 
 
 
529 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  24.81 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.42 
 
 
789 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.57 
 
 
810 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  23.68 
 
 
176 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  24.59 
 
 
172 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  29.2 
 
 
106 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  25.71 
 
 
391 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>