More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1407 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 98 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 95 aa  121  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  60.2 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  60.2 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  60.2 
 
 		 98 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  60.64 
 
 		 98 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  58.51 
 
 		 95 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  57.45 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 104 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  56.84 
 
 		 103 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 96 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 99 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  58.76 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 103 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>