62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  71.16 
 
 
270 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  61.21 
 
 
285 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  60.59 
 
 
280 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  62.78 
 
 
278 aa  330  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  60.08 
 
 
269 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  63.22 
 
 
264 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  61.92 
 
 
278 aa  324  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  60.46 
 
 
271 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  58.7 
 
 
275 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  58.27 
 
 
273 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  57.62 
 
 
276 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  57.79 
 
 
272 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  59.18 
 
 
279 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  56.13 
 
 
269 aa  292  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  52.82 
 
 
318 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  52.52 
 
 
680 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  57.25 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  54.92 
 
 
271 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  56.67 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  57.25 
 
 
302 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  53.65 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  53.76 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  51.59 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  53.76 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  53.76 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  53.31 
 
 
302 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  53.26 
 
 
356 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  48.46 
 
 
268 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.03 
 
 
705 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  39.03 
 
 
705 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.17 
 
 
705 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  42.55 
 
 
296 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  37.55 
 
 
703 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  37.59 
 
 
704 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  37.92 
 
 
703 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  35.21 
 
 
703 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  33.21 
 
 
275 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  36.92 
 
 
294 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  33.21 
 
 
275 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  35.29 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  34.56 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  32.54 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  21.05 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  29.05 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  22.93 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  20.61 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  24.63 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  26.34 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  27.05 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  27.2 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  24.9 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  21.43 
 
 
407 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  26.03 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  28.27 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  26.34 
 
 
261 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  25 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  22.62 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  23.36 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  26.3 
 
 
419 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  25.31 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  26.99 
 
 
436 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>