19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5377 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5377  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2254  hypothetical protein  33.05 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136366  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4382  Ricin B lectin  32.65 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.488443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4381  Ricin B lectin  33.17 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2929  hypothetical protein  34.2 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  35.68 
 
 		 1057 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3801  fibronectin type III domain-containing protein  32.07 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00993794  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  36.45 
 
 		 1053 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26650  hypothetical protein  31.06 
 
 		 845 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.822995  normal  0.342993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  26.44 
 
 		 1157 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  31.16 
 
 		 980 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  27.14 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26660  hypothetical protein  29.71 
 
 		 738 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.794226  normal  0.474919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  29 
 
 		 1073 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  29.29 
 
 		 1034 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  27.27 
 
 		 894 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  25.11 
 
 		 894 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.08 
 
 		 804 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  24.31 
 
 		 618 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>