More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4425 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4425  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
302 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4423  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.19 
 
 
303 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.601642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.77 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7645  oxidoreductase  41.85 
 
 
309 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0449  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.81 
 
 
310 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.275954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3845  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.45 
 
 
307 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4574  oxidoreductase  39.34 
 
 
307 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.561951  normal  0.180256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.22 
 
 
306 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2004  alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
314 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3672  alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
323 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
326 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  31.39 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  31.07 
 
 
325 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.26 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1211  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.97 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.09 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.43 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.65 
 
 
330 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.72 
 
 
332 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.91 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.53 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.43 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.92 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.86 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
330 aa  89.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.62 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.52 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.43 
 
 
332 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  25.43 
 
 
332 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.72 
 
 
332 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.45 
 
 
324 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1657  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000320474  normal  0.0104238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.86 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.89 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.09 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.044978  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03640  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.83 
 
 
353 aa  87  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.58 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.08 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.78 
 
 
326 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.64 
 
 
328 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.43 
 
 
332 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  34.68 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  30.5 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.66 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.56 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.3 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.56 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  32.09 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.61 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.84 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.4 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.86 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.79 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.65 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.8 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.99 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00900  enoyl reductase, putative  33.15 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.67 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.2 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.96 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.47 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.14 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.17 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  30.94 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2386  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357154  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.85 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.56 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>