24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3050 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  79.83 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  84.55 
 
 		 115 aa  185  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  79.13 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  78.76 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  77.59 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  76.07 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  64.04 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  61.26 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  47.41 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  46.55 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  43.75 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  47.32 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  67.35 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  26.96 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  28.21 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2084  putative hydrolase  33.94 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0929909  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0608  hypothetical protein  36.67 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4697  hypothetical protein  32.48 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0475131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  54.76 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  29.73 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>