More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3049 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  100 
 
 
414 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  35.81 
 
 
451 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  38.23 
 
 
466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  43.78 
 
 
419 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  40.64 
 
 
428 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  36.5 
 
 
490 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  36.85 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  36.11 
 
 
451 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  37.35 
 
 
456 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  36.69 
 
 
466 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  33.01 
 
 
504 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  32.15 
 
 
501 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  38.48 
 
 
482 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  31.06 
 
 
459 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  33.77 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  33.33 
 
 
480 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  33.48 
 
 
520 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  32.02 
 
 
461 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  33.25 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  28.12 
 
 
442 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  29.83 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  32.47 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  29.33 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.74 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.88 
 
 
431 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  27.76 
 
 
431 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  31.63 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.18 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  28.88 
 
 
430 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.37 
 
 
434 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.98 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.72 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  24.16 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.54 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  24.42 
 
 
422 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  31.58 
 
 
432 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  25.52 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.23 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  26.88 
 
 
416 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  28.46 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  27.66 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.48 
 
 
428 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.9 
 
 
434 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.26 
 
 
420 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.57 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  30.42 
 
 
440 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.25 
 
 
432 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  23.38 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.45 
 
 
448 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  29.59 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.95 
 
 
439 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  21.45 
 
 
428 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0346  amidohydrolase  23.94 
 
 
416 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  26.67 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.98 
 
 
461 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.5 
 
 
438 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.21 
 
 
426 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.08 
 
 
433 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  32.27 
 
 
474 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  25.54 
 
 
381 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.25 
 
 
441 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  30.69 
 
 
477 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  30 
 
 
458 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  25.38 
 
 
405 aa  106  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.78 
 
 
455 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  26.96 
 
 
465 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.91 
 
 
440 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  26.33 
 
 
406 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  25.5 
 
 
438 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  24.32 
 
 
462 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  31.7 
 
 
473 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.96 
 
 
469 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.99 
 
 
454 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.44 
 
 
443 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  29.07 
 
 
440 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  28.08 
 
 
490 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.11 
 
 
441 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  25.31 
 
 
449 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.78 
 
 
442 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  29.06 
 
 
509 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.22 
 
 
444 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  27.18 
 
 
433 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.39 
 
 
432 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.78 
 
 
444 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  24.15 
 
 
442 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.34 
 
 
431 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  22.36 
 
 
445 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  28.26 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  28.26 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25 
 
 
484 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.51 
 
 
451 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.29 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.12 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  24.94 
 
 
468 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.95 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  24.69 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.47 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.71 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.85 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>