207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2192 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 
461 aa  893    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  73.91 
 
 
473 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  80.09 
 
 
475 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  70.37 
 
 
462 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  72.43 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  70.07 
 
 
480 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  72.43 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  72.43 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  70.82 
 
 
463 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  75.93 
 
 
464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  69.96 
 
 
463 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  67.69 
 
 
469 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  73.18 
 
 
459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  66.23 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  66.67 
 
 
478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  67.48 
 
 
471 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  64.76 
 
 
475 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  69.63 
 
 
476 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  65.72 
 
 
465 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  68.41 
 
 
469 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  63.12 
 
 
511 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  62.55 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  62.63 
 
 
507 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  61.14 
 
 
477 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.87 
 
 
464 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.05 
 
 
460 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.42 
 
 
505 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.07 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.48 
 
 
487 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.55 
 
 
502 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.03 
 
 
475 aa  352  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  47.61 
 
 
510 aa  346  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.06 
 
 
486 aa  342  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.63 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  46.76 
 
 
512 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  39.18 
 
 
497 aa  332  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.35 
 
 
487 aa  329  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  43.61 
 
 
473 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  41.98 
 
 
473 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.52 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.79 
 
 
334 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.25 
 
 
374 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.23 
 
 
304 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.68 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.67 
 
 
357 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.3 
 
 
341 aa  56.6  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.92 
 
 
340 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.42 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.62 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.31 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  27.12 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  27.12 
 
 
334 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.51 
 
 
368 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.51 
 
 
340 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.8 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.24 
 
 
306 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.79 
 
 
307 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.06 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.82 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.82 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  28.52 
 
 
304 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.18 
 
 
306 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.21 
 
 
337 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.16 
 
 
336 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.18 
 
 
306 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  26.69 
 
 
334 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.21 
 
 
337 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.05 
 
 
688 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.64 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.58 
 
 
337 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  29.47 
 
 
689 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  26.05 
 
 
296 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  26.05 
 
 
296 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.42 
 
 
341 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  30.47 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.64 
 
 
348 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  27.66 
 
 
372 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.79 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.16 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  28.71 
 
 
334 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.63 
 
 
673 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.86 
 
 
678 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.33 
 
 
332 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  35.29 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  26.29 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  30.95 
 
 
683 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.46 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  26.29 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.63 
 
 
673 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  26.29 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.31 
 
 
403 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  34.78 
 
 
611 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  27.47 
 
 
680 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  28.9 
 
 
660 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.59 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  25.1 
 
 
302 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.71 
 
 
671 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  33.33 
 
 
352 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.57 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>