19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0130 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0129  hypothetical protein  76.03 
 
 		 267 aa  349  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0131  hypothetical protein  55.08 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  32.6 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.81 
 
 		 371 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  28.5 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  31.05 
 
 		 3373 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  30.59 
 
 		 2047 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  34.91 
 
 		 5517 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  38.67 
 
 		 2604 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  57.58 
 
 		 5544 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  35.19 
 
 		 1243 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  34.15 
 
 		 8918 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  44.19 
 
 		 2876 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1665 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  39.71 
 
 		 2656 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  27.22 
 
 		 436 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  48.08 
 
 		 2112 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  41.82 
 
 		 870 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>