19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3173 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 937 aa  1833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  38.33 
 
 		 654 aa  317  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  38.76 
 
 		 654 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 1157 aa  247  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  37.16 
 
 		 564 aa  197  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  39.06 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  39.06 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 940 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 955 aa  128  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  41.74 
 
 		 990 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  41.74 
 
 		 990 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  41.74 
 
 		 990 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  41.74 
 
 		 990 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  41.74 
 
 		 990 aa  85.9  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  28.99 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  28.99 
 
 		 1001 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  28.15 
 
 		 1000 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.03 
 
 		 745 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  35.59 
 
 		 550 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>