26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2183 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  289  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  95.3 
 
 
149 aa  230  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  94.63 
 
 
149 aa  223  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  64.62 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  60.4 
 
 
148 aa  170  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  60.4 
 
 
148 aa  169  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  58.39 
 
 
148 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  58.39 
 
 
148 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  58.39 
 
 
148 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  63.03 
 
 
152 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  77.78 
 
 
148 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  66.67 
 
 
148 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  66.67 
 
 
120 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  54.2 
 
 
140 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  46.34 
 
 
138 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  49.14 
 
 
143 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  47.58 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  36.92 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  35.85 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  35.85 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  34.21 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  27.82 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  33.06 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2754  hypothetical protein  30.93 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>