44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1550 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1192    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  56.77 
 
 		 571 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  55.34 
 
 		 549 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  34.72 
 
 		 721 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  31.57 
 
 		 611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  30.6 
 
 		 990 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4267  relaxase  30.33 
 
 		 642 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  29.59 
 
 		 1096 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  24.73 
 
 		 941 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5223  hypothetical protein  25.56 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  25.8 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  25.85 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  25 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  24.27 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  26.1 
 
 		 615 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 861 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  25.94 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  24.2 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  23.7 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  26.02 
 
 		 623 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  24.38 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  25.78 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  24.8 
 
 		 599 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  24.18 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  25.87 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3751  hypothetical protein  28.86 
 
 		 373 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6503  hypothetical protein  25.17 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.842994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5612  hypothetical protein  25.87 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  25.4 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  25.8 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  22.13 
 
 		 640 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  25.19 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  22.43 
 
 		 624 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  22.86 
 
 		 643 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  22.66 
 
 		 639 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  24 
 
 		 595 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  21.63 
 
 		 639 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  23.37 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1519  hypothetical protein  26.96 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6308  hypothetical protein  32.53 
 
 		 413 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5184  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  26.96 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  24.41 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4329  hypothetical protein  24.14 
 
 		 408 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  22.08 
 
 		 631 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>