More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1911 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  100 
 
 
268 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  52.29 
 
 
276 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
279 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  43.89 
 
 
397 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  50.76 
 
 
271 aa  221  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 
298 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
298 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  48.82 
 
 
272 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
291 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 
277 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 
286 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
284 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  48.68 
 
 
291 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  52.26 
 
 
281 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  49.06 
 
 
297 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 
298 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  49.07 
 
 
311 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  55.19 
 
 
290 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 
277 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 
278 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 
277 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 
277 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 
288 aa  205  6e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
274 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
277 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
284 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 
277 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.75 
 
 
280 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11700  dihydropteroate synthase  51.25 
 
 
283 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.407826  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  47.29 
 
 
265 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2900  dihydropteroate synthase  55.24 
 
 
277 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  51.38 
 
 
286 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 
264 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
279 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 
277 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 
277 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 
277 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 
277 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
283 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 
264 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  48.59 
 
 
299 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.69 
 
 
437 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
293 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  48.24 
 
 
289 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
277 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
400 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 
283 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  47.29 
 
 
265 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  52.59 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  49.21 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  52.4 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 
283 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 
300 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.53 
 
 
266 aa  199  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
275 aa  198  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  52.8 
 
 
435 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  48.19 
 
 
277 aa  198  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  40.91 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  48.16 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  48.15 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  50.95 
 
 
302 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  48.39 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 
277 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.96 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  48.33 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  42.02 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
287 aa  195  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  47.97 
 
 
332 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 
277 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
287 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>