27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1411 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1411    100 
 
 
906 bp  1796    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02981  putative transposase  91.11 
 
 
813 bp  58  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0928  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  80.29 
 
 
720 bp  58  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.394905  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4425  integrase, catalytic region  86.89 
 
 
606 bp  58  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0892    86.89 
 
 
2308 bp  58  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228835  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  96.88 
 
 
876 bp  56  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  96.88 
 
 
876 bp  56  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  94.29 
 
 
840 bp  54  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06225  transposase and inactivated derivatives  92.31 
 
 
291 bp  54  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01089  transposase and inactivated derivatives  92.31 
 
 
291 bp  54  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  94.29 
 
 
840 bp  54  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  94.29 
 
 
840 bp  54  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0173  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 
816 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  92.11 
 
 
888 bp  52  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3924  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 
816 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1964  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 
816 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1465  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 
816 bp  52  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  85.25 
 
 
852 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1786  integrase catalytic region  85.25 
 
 
753 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0688    87.5 
 
 
216 bp  48.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  91.67 
 
 
816 bp  48.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  91.67 
 
 
816 bp  48.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>