123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2259 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  100 
 
 		 184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  32.95 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  29.84 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  28.9 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  27.01 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  29.33 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  27.37 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  30.84 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  27.94 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  33.08 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  30.19 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  29.91 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  29.38 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  27.39 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  30 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  30.88 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  28.03 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  26.54 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  25 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  28.78 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  22.04 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  25.55 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  27.78 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  28.93 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  34.13 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  30.77 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  32.17 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  25.44 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  29.63 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  30.91 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  27.64 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  25.13 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  28.17 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  32.8 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  26.75 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  26.11 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  27.22 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  25.86 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  37.27 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  33.02 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  26.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  29.11 
 
 		 248 aa  48.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  37.27 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  20.3 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.04 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  28 
 
 		 166 aa  47.8  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3372  colicin V production protein  33.64 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00676354  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  27.08 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  25.14 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  28.92 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.66 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  28.97 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  25.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.79 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  27.33 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  26.67 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  31.13 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  27.17 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  27.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  26.11 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  26.17 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  27.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.93 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  29.45 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  37.5 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  28.93 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  24.65 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  28.97 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1277  Colicin V production protein  28.18 
 
 		 414 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  26.4 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  34.23 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  25 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  34.23 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  28.89 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  28.72 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  28.72 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  31.01 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  23.57 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  29.73 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  32.43 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  32.43 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  32.43 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  30.77 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  24.31 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  24.31 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  24.31 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  32.43 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  23.45 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  28.8 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  24.46 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  26.53 
 
 		 198 aa  42  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  25.17 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  28.8 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  29.2 
 
 		 197 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  23.45 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>