21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1170 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1170  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  336  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3035  putative signal peptide protein  48.41 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3382  conserved hypothetical signal peptide protein  46.97 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.2 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0272  cupin region  42.58 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3937  cupin region  45.24 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0721  cupin 2, barrel  42.28 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3547  cupin region  46.03 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3099  putative signal peptide protein  44.35 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0932  cupin 2 conserved barrel domain protein  44.26 
 
 		 162 aa  97.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1520  cupin region  40.98 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.181654  normal  0.367845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0322  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0562  cupin 2, barrel  40.98 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.988265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.42 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.346504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0092  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0147  hypothetical protein  44.95 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.820843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2078  hypothetical protein  33.97 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0310  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0170158  normal  0.139977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  34.44 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2659  hypothetical protein  26.11 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1816  cupin 2, conserved barrel  30.53 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>