30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1487 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  35.33 
 
 
287 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  34.36 
 
 
289 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  36.95 
 
 
615 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  37.37 
 
 
617 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  39.89 
 
 
556 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  37.7 
 
 
520 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  40.25 
 
 
550 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  43.92 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  35.82 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  41.89 
 
 
189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  40.26 
 
 
200 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  39.33 
 
 
208 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  33.33 
 
 
213 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  39.24 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  36.45 
 
 
201 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  33.86 
 
 
204 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  39.04 
 
 
197 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  34.23 
 
 
191 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  36.67 
 
 
228 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.46 
 
 
332 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  25.7 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.17 
 
 
237 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  29.55 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0714  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.67 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0865447  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0323  hypothetical protein  43.64 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809023  hitchhiker  0.00182962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0519  hypothetical protein  43.18 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1589  hypothetical protein  43.18 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0393  hypothetical protein  43.64 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0670044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>