More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2536 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
352 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  82.08 
 
 
348 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  82.08 
 
 
348 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  77.42 
 
 
348 aa  517  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.72 
 
 
359 aa  474  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  67.63 
 
 
348 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 
350 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.7 
 
 
385 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.22 
 
 
344 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.95 
 
 
344 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.95 
 
 
344 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.24 
 
 
344 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.37 
 
 
344 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.87 
 
 
349 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.61 
 
 
344 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.83 
 
 
385 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.64 
 
 
344 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.64 
 
 
344 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.83 
 
 
385 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.29 
 
 
349 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.91 
 
 
344 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.06 
 
 
344 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  54.39 
 
 
351 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  49.42 
 
 
344 aa  348  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  48.41 
 
 
340 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  49.12 
 
 
352 aa  342  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  49.28 
 
 
339 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  49.42 
 
 
342 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50 
 
 
342 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
397 aa  332  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
341 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
341 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.58 
 
 
341 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  47.48 
 
 
339 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  48.3 
 
 
341 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  49.58 
 
 
345 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 
339 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  48.3 
 
 
341 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
339 aa  328  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  49.72 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  53.6 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  51.59 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  48.01 
 
 
341 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.95 
 
 
377 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  50.29 
 
 
340 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  55.03 
 
 
353 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  54.91 
 
 
387 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  54.72 
 
 
353 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  54.72 
 
 
353 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0195  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
346 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0176  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
346 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00383755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0174  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
346 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.157332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.12 
 
 
343 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
343 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.73 
 
 
382 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
356 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
368 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
343 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
343 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
343 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
343 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0198  ABC transporter, ATP-binding protein  46.2 
 
 
346 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0166  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
346 aa  315  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.766032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 
346 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 
346 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 
346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.7 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.99 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  48.54 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  51.19 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.7 
 
 
310 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 
343 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.41 
 
 
345 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  48.28 
 
 
343 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>