29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1923 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 		 375 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  58.01 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  52.24 
 
 		 361 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1460  periplasmic lipolike protein  56.94 
 
 		 371 aa  299  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  28.07 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  26.32 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  25.82 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  27.67 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  24.7 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.76 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  26.65 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  22.52 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  24.27 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  24.84 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  24.85 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  21.81 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.46 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  23.62 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  23.89 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  23.89 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  24.52 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  24.57 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  21.22 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  28.18 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  24.85 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  23.28 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>