25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1369 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  100 
 
 		 259 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  69.86 
 
 		 149 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  66.2 
 
 		 150 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 		 143 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  28.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  28.99 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 147 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  29.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 134 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  30.66 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 136 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  28.78 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  27.61 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  24.29 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  28.36 
 
 		 137 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>