More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02251 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  46.52 
 
 		 867 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  45.68 
 
 		 865 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 		 920 aa  1836    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0564  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.45 
 
 		 869 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24612  chaperone, Hsp100 family, ClpB-type  37.42 
 
 		 923 aa  643    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.311804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  40.7 
 
 		 872 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  47.22 
 
 		 854 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  45.12 
 
 		 861 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  39.18 
 
 		 863 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  46.82 
 
 		 858 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  46.82 
 
 		 858 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  45.69 
 
 		 854 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  45.04 
 
 		 865 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  37.69 
 
 		 878 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1574  ATPase  50.7 
 
 		 931 aa  879    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.513125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0993  ATPase  45.92 
 
 		 869 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.590377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  38.39 
 
 		 891 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  40.88 
 
 		 873 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  42.11 
 
 		 876 aa  727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  40.79 
 
 		 872 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  42.66 
 
 		 894 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  42.01 
 
 		 859 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27741  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  49.46 
 
 		 926 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  46.82 
 
 		 866 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000217935  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  39.43 
 
 		 862 aa  674    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  45.75 
 
 		 941 aa  857    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  39.78 
 
 		 862 aa  652    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2474  ATPase  47.58 
 
 		 924 aa  877    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.786045  normal  0.0534702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  47.11 
 
 		 864 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  44.68 
 
 		 862 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4187  ATPase  40.04 
 
 		 893 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0209  ATPase  91.31 
 
 		 918 aa  1679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0637  ATPase  48.6 
 
 		 895 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0120026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  40.11 
 
 		 883 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  45.82 
 
 		 869 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  44.63 
 
 		 864 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0981  ATP-dependent chaperone ClpB  41.16 
 
 		 872 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  40.69 
 
 		 888 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5181  ATP-dependent chaperone ClpB  41.2 
 
 		 854 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  41.16 
 
 		 872 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  42.28 
 
 		 890 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  45.73 
 
 		 865 aa  637    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0974  ATPase  45.92 
 
 		 869 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02271  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  95.77 
 
 		 918 aa  1707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  47.19 
 
 		 861 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  40.61 
 
 		 866 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02831  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.65 
 
 		 931 aa  886    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  48.1 
 
 		 858 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  40.28 
 
 		 870 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  41.06 
 
 		 905 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  40.56 
 
 		 899 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  46.62 
 
 		 861 aa  646    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  46.76 
 
 		 871 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02251  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  50.32 
 
 		 920 aa  900    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  44.32 
 
 		 878 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  41.31 
 
 		 854 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  40.61 
 
 		 866 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02361  putative ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  76.11 
 
 		 915 aa  1356    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  46.55 
 
 		 871 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0007  ATP-dependent chaperone ClpB  40.69 
 
 		 888 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  40.13 
 
 		 872 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  39.82 
 
 		 863 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  47.01 
 
 		 859 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  46.57 
 
 		 864 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  45.39 
 
 		 865 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  45.08 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  45.61 
 
 		 887 aa  635  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  46.31 
 
 		 854 aa  633  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  43.77 
 
 		 867 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1601  ATP-dependent chaperone ClpB  47.08 
 
 		 864 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  41.98 
 
 		 868 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3639  ATPase  46.09 
 
 		 854 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  45.83 
 
 		 854 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  39.57 
 
 		 863 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  37.55 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  45.64 
 
 		 854 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  38.38 
 
 		 870 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  45.73 
 
 		 870 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  45.19 
 
 		 861 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  46.74 
 
 		 866 aa  631  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  46.51 
 
 		 860 aa  632  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1839  ATP-dependent chaperone ClpB  42.03 
 
 		 873 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  46.87 
 
 		 857 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  45.53 
 
 		 863 aa  630  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0567  ATP-dependent chaperone ClpB  44.83 
 
 		 862 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01200  ATP-dependent chaperone ClpB  46.45 
 
 		 891 aa  628  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.98 
 
 		 861 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  46.18 
 
 		 857 aa  629  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  38.94 
 
 		 866 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  43.13 
 
 		 879 aa  628  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.63 
 
 		 863 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  45.53 
 
 		 870 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0885  ATPase  45.65 
 
 		 866 aa  629  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  38.94 
 
 		 866 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  38.27 
 
 		 870 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  37.99 
 
 		 891 aa  629  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  45.76 
 
 		 865 aa  626  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  38.38 
 
 		 870 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  44.59 
 
 		 862 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  43.16 
 
 		 874 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>