More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01671 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_01651  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  83.37 
 
 
558 aa  860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01671  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  100 
 
 
534 aa  1068    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1516  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  83.76 
 
 
538 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01691  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  98.68 
 
 
531 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  68.24 
 
 
525 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4388  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  69.9 
 
 
526 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26711  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.11 
 
 
563 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5216  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  69.14 
 
 
531 aa  712    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4450  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  69.9 
 
 
526 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.487224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0292  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  76.49 
 
 
548 aa  813    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  77.08 
 
 
533 aa  833    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0152  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  97.19 
 
 
534 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  69.94 
 
 
534 aa  728    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  69.86 
 
 
524 aa  724    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01781  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  92.68 
 
 
546 aa  986    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0659  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  68.27 
 
 
527 aa  706    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.79601  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02221  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  82.24 
 
 
538 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  65.23 
 
 
537 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.49 
 
 
537 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  59.05 
 
 
532 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000163526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  54.84 
 
 
534 aa  583  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1439  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  57.86 
 
 
533 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.5 
 
 
563 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  53.86 
 
 
560 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.05 
 
 
560 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2308  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  53.28 
 
 
561 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4656  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.54 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000336952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.72 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.47 
 
 
523 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  53.78 
 
 
523 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  57.94 
 
 
511 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54 
 
 
524 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.09 
 
 
524 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.32 
 
 
504 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.98 
 
 
512 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.57 
 
 
513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.17 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.57 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.02 
 
 
503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.87 
 
 
517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.78 
 
 
525 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.59 
 
 
519 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  35.99 
 
 
501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.35 
 
 
497 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.21 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.43 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  34.71 
 
 
522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.09 
 
 
527 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.09 
 
 
527 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.6 
 
 
495 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.5 
 
 
504 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.85 
 
 
535 aa  302  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  35.34 
 
 
513 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.01 
 
 
525 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.89 
 
 
535 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  38.25 
 
 
514 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.3 
 
 
507 aa  301  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.6 
 
 
535 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4249  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  35.63 
 
 
523 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4311  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  35.63 
 
 
523 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0412601  hitchhiker  0.0081583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.17 
 
 
488 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.63 
 
 
545 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.62 
 
 
527 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  36.75 
 
 
509 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1099  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M  35.36 
 
 
496 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.92 
 
 
509 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.72 
 
 
503 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.15 
 
 
545 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  36.53 
 
 
495 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  36.44 
 
 
513 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.79 
 
 
505 aa  296  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.62 
 
 
497 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  34.94 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.73 
 
 
506 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.9 
 
 
545 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.76 
 
 
503 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.9 
 
 
545 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.46 
 
 
506 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  35.9 
 
 
505 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  36.56 
 
 
509 aa  295  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  34.54 
 
 
513 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  33.68 
 
 
504 aa  294  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0833  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.04 
 
 
488 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  35.89 
 
 
503 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  34.35 
 
 
513 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  35.51 
 
 
494 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  35.53 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  36.45 
 
 
493 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  34.03 
 
 
515 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  35.86 
 
 
488 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  35.93 
 
 
496 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  35.93 
 
 
496 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  35.93 
 
 
496 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>