35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00871 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  94.46 
 
 
361 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  90.98 
 
 
366 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  752    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  75.94 
 
 
368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  57.53 
 
 
365 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  57.38 
 
 
357 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  56.99 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  57.26 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  55.34 
 
 
363 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  52.86 
 
 
365 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  36.07 
 
 
413 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  35.02 
 
 
416 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  33.99 
 
 
452 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  33.18 
 
 
420 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  33.82 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  33.33 
 
 
387 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  33.33 
 
 
387 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  32.29 
 
 
1035 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  32.21 
 
 
731 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  38.14 
 
 
163 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  25.47 
 
 
497 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  38.04 
 
 
903 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1503  hypothetical protein  52.63 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.455451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  26.13 
 
 
235 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  25.42 
 
 
261 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  26.05 
 
 
263 aa  53.1  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  23.7 
 
 
251 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  24.82 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  30.19 
 
 
273 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  29.21 
 
 
248 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1407  hypothetical protein  27.01 
 
 
179 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  29.55 
 
 
244 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  27.5 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01061  hypothetical protein  24.82 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  0.482595 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  22.1 
 
 
251 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>