31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4421 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  96.93 
 
 
717 aa  1226    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1373    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  99.16 
 
 
717 aa  1360    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  75.14 
 
 
720 aa  914    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  33.48 
 
 
703 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  29.76 
 
 
710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  25.91 
 
 
825 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  26.07 
 
 
773 aa  92  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  30.32 
 
 
660 aa  77.4  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  21.35 
 
 
682 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  31.08 
 
 
684 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  38.16 
 
 
872 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  27.54 
 
 
641 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  26.74 
 
 
933 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  29.31 
 
 
677 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1217  hypothetical protein  29.66 
 
 
700 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.604132  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1934  hypothetical protein  22.42 
 
 
627 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0768843  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  31.37 
 
 
937 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  29.02 
 
 
939 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2450  hypothetical protein  24.7 
 
 
640 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  26.34 
 
 
957 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  38.81 
 
 
939 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  39.44 
 
 
914 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  36.36 
 
 
937 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  35.9 
 
 
938 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1322  hypothetical protein  30.36 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.143709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  33.98 
 
 
945 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  31.73 
 
 
939 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  33.01 
 
 
943 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0802  hypothetical protein  21.55 
 
 
623 aa  44.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  29.04 
 
 
690 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>