32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4345 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4345  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 386 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.861671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  91.19 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  97.35 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  66.37 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  40.83 
 
 		 986 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 		 1838 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  29.22 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  33.33 
 
 		 538 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.71 
 
 		 872 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 713 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.54 
 
 		 648 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 		 208 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  43.59 
 
 		 605 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  43.59 
 
 		 571 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.85 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  41.03 
 
 		 610 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 3560 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1005 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1542 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.93 
 
 		 880 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 673 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  46.15 
 
 		 1163 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 767 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>