18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3780 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3639  LigA  91.02 
 
 		 948 aa  1506    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  100 
 
 		 948 aa  1828    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  89.87 
 
 		 951 aa  1426    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  46.67 
 
 		 366 aa  72  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  34.41 
 
 		 1209 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  34.41 
 
 		 1209 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  31.97 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.87 
 
 		 1224 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  36 
 
 		 638 aa  54.7  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 1224 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 1224 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  32.98 
 
 		 819 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.04 
 
 		 1237 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  31.97 
 
 		 676 aa  48.5  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  28.16 
 
 		 851 aa  46.2  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  30.53 
 
 		 817 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  29.63 
 
 		 818 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  28.32 
 
 		 807 aa  45.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>