44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3264 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  100 
 
 
189 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  89.23 
 
 
195 aa  346  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  92.15 
 
 
191 aa  339  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  61.26 
 
 
190 aa  232  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  58.82 
 
 
196 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  57.99 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  53.63 
 
 
199 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1834  putative lipoprotein  34.21 
 
 
389 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  28.48 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  28.48 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1122  lipoprotein, putative  31.25 
 
 
375 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000681269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2978  hypothetical protein  27.92 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135615  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  28.68 
 
 
449 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  27.63 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  26.39 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  26.39 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  35.23 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  26.39 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  27.63 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  27.63 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  34.09 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  28.86 
 
 
221 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2497  putative lipoprotein  29.71 
 
 
392 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  34.09 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  26.42 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  25.71 
 
 
219 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  29.03 
 
 
219 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  27.47 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  26.45 
 
 
228 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  26.45 
 
 
228 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  25.81 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  24.67 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3070  putative lipoprotein  30.51 
 
 
395 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  25.34 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3263  lipoprotein, putative  28.81 
 
 
397 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1993  hypothetical protein  23.66 
 
 
374 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.644262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>