20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0477 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  98.73 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  96.19 
 
 		 235 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  38.17 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  37.08 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  38.75 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  28.28 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  26.54 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.84 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  32.39 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  23.04 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  30.16 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  28.39 
 
 		 547 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  22.43 
 
 		 565 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  23.83 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  21.72 
 
 		 582 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  24.02 
 
 		 525 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  21.33 
 
 		 499 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  19.31 
 
 		 227 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>