19 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Avi_0293  CDS  NC_011989  249043  249738  696  hypothetical protein  YP_002548193  unclonable  0.000191826  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0387  CDS  NC_011989  331220  332803  1584  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  YP_002548269  unclonable  0.00400126  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0443  CDS  NC_011989  378110  378532  423  transcriptional regulator  YP_002548313  unclonable  5.54716e-05  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_0888  CDS  NC_011989  749556  751367  1812  exopolyphosphatase  YP_002548630  unclonable  0.00574973  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_1164  CDS  NC_011989  987272  988027  756  transcriptional regulator DeoR family  YP_002548836  unclonable  0.000280656  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_1349  CDS  NC_011989  1128257  1128856  600  hypothetical protein  YP_002548968  unclonable  8.19599e-05  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_3073  CDS  NC_011989  2550108  2550458  351  hypothetical genomic island protein  YP_002550216  unclonable  7.87321e-05  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_3074  CDS  NC_011989  2550909  2551268  360  hypothetical protein  YP_002550217  unclonable  4.8216e-05  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_3075  CDS  NC_011989  2551299  2551637  339  hypothetical protein  YP_002550218  unclonable  4.02661e-05  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_3713  CDS  NC_011989  3077184  3078425  1242  hypothetical protein  YP_002550681  unclonable  0.000844508  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_4229  CDS  NC_011989  3556445  3556900  456  hypothetical protein  YP_002551075  unclonable  0.000114025  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_4365  CDS  NC_011989  3680921  3682795  1875  hypothetical protein  YP_002551182  unclonable  0.00793979  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5482  CDS  NC_011988  477468  478265  798  lipase esterase  YP_002547311  unclonable  0.000559952  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5600  CDS  NC_011988  611477  612628  1152  hypothetical protein  YP_002547411  unclonable  0.00091534  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5634  CDS  NC_011988  660333  662039  1707  hypothetical protein  YP_002547441  unclonable  0.00869862  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_5725  CDS  NC_011988  746023  746946  924  DNA-binding HTH domain-containing protein  YP_002547516  unclonable  0.000726612  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_7337  CDS  NC_011981  314967  316262  1296  ABC transporter substrate binding protein  YP_002539709  unclonable  0.00127436  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_7676  CDS  NC_011981  605730  607205  1476  FAD dependent oxidoreductase  YP_002539961  unclonable  0.00241986  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_7680  CDS  NC_011981  609978  611372  1395  porin B  YP_002539964  unclonable  0.00131365  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>