More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7676 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7676  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 491 aa  989    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.1 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  26.43 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  23.36 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.29 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.46 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1840  FAD linked oxidase domain protein  25.05 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.86 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.51 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  22.25 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.08 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  23.47 
 
 		 497 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.05 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.62 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.31 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  20.92 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3838  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.41 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.1 
 
 		 1023 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.33 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  21.26 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  25.1 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  22.11 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  20.92 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.94 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.65 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.34 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  21.91 
 
 		 464 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  25.91 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.89 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  21.67 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  22.63 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  23.95 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  23.92 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.89 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.89 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.89 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.23 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.89 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  24.74 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  24.4 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  22.36 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.57 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.57 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.05 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  29.09 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.71 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.41 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  22.25 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  28.06 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  23.59 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  24.18 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  22.68 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.49 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.51 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.77 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  22.88 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.71 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  25.11 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  27.41 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  21.17 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  21.31 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.41 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  22.05 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  22.73 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  24.75 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1706  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3879  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.57 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.92 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.55 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  23.54 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  21.21 
 
 		 462 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  24.45 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 		 475 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  21.38 
 
 		 480 aa  57  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  25.51 
 
 		 468 aa  57  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 495 aa  57  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.27 
 
 		 890 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.52 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.15 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.41 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  27.41 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  23.45 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.85 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.55 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1475  FAD linked oxidase-like  28.35 
 
 		 514 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  25.35 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>