21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3075 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000402661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3041  hypothetical protein  61.46 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1156  putative transcriptional regulator, Nlp  50 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3226  putative transcriptional regulator, Nlp  48.44 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4530  putative transcriptional regulator, Nlp  38.1 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3624  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  43.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000112676  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0642  putative transcriptional regulator, Nlp  43.86 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2923  regulator for maltose metabolism  37.68 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.585946  hitchhiker  0.000573854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0716  putative transcriptional regulator, Nlp  43.86 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0904  putative transcriptional regulator, Nlp  42.11 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3582  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000128887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3484  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1499  putative transcriptional regulator, Nlp  37.68 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4510  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000173823  normal  0.989059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0512  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00792523  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3674  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000245741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03004  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0319542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3381  DNA-binding transcriptional regulator Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0519  putative transcriptional regulator, Nlp  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3282  putative transcriptional regulator, Nlp  41.38 
 
 		 95 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03053  DNA-binding transcriptional activator of maltose metabolism  41.38 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.044476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>