26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0086 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5333  hypothetical protein  32.72 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  44.33 
 
 
1009 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 
1821 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  43.02 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  43.37 
 
 
1732 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  36.14 
 
 
576 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  44.05 
 
 
981 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  45.24 
 
 
306 aa  62  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  39.02 
 
 
1831 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  44.58 
 
 
526 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  43.9 
 
 
1418 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  43.48 
 
 
1048 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  40.22 
 
 
556 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  40.24 
 
 
1300 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  42.25 
 
 
1171 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  38.1 
 
 
428 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.82 
 
 
2638 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 
1732 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  41.18 
 
 
437 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.47 
 
 
4630 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 
389 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  41.54 
 
 
1467 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  41.54 
 
 
1937 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  43.64 
 
 
554 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  35.8 
 
 
688 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>