33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2222 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  956    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  63.11 
 
 
490 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  56.49 
 
 
477 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  35.2 
 
 
522 aa  279  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  36.95 
 
 
507 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.75 
 
 
487 aa  103  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  29.64 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  24.55 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  25.7 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  27.71 
 
 
490 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.4 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  27.63 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  28.01 
 
 
538 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.86 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  27.96 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  29.68 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  29.14 
 
 
488 aa  63.9  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  30 
 
 
480 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  25.46 
 
 
515 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  26.94 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  29.52 
 
 
482 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  26.45 
 
 
484 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  29.52 
 
 
483 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  30.1 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  23.97 
 
 
478 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  26.57 
 
 
481 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  25.83 
 
 
412 aa  57.4  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  29.19 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  26.3 
 
 
484 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  25.29 
 
 
486 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  23.55 
 
 
494 aa  47  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  23.19 
 
 
510 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  24.91 
 
 
510 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>