24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1278 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  62.94 
 
 		 620 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  55.12 
 
 		 645 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 617 aa  1211    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  56.77 
 
 		 623 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  28.23 
 
 		 634 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  32.26 
 
 		 615 aa  176  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  32.63 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  29.64 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 		 623 aa  80.1  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  26.74 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  24.27 
 
 		 713 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  27.37 
 
 		 621 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  25.15 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  24.84 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000466586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  24.12 
 
 		 708 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  26.12 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  25.79 
 
 		 296 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  28.9 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  29.13 
 
 		 495 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  26.36 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  23.32 
 
 		 285 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 398 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 287 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>