88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0281 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  100 
 
 
150 aa  305  2e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  56.85 
 
 
153 aa  175  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  56 
 
 
153 aa  168  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  56.08 
 
 
149 aa  158  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  38.1 
 
 
149 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  39.07 
 
 
153 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  37.33 
 
 
151 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  38.67 
 
 
151 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  36.91 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  36.24 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  35.76 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  35.76 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.72435e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  35.76 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  35.1 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  35.76 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  36.73 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  35.37 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  36.22 
 
 
150 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  39.72 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  39.72 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  39.72 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  33.33 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  32 
 
 
153 aa  81.6  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.71 
 
 
148 aa  82  3e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  33.55 
 
 
153 aa  80.9  5e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  80.5  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  80.1  9e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  34.9 
 
 
155 aa  76.3  1e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 
151 aa  76.6  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  31.58 
 
 
153 aa  75.5  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  34.35 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  34.35 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  34.35 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  34.35 
 
 
150 aa  75.9  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  34.9 
 
 
155 aa  74.7  3e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 
144 aa  70.9  5e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  70.9  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  70.9  5e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  27.03 
 
 
153 aa  70.9  6e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  28.47 
 
 
148 aa  69.7  1e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  29.25 
 
 
149 aa  69.7  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 
150 aa  70.1  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  67.8  4e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  28.95 
 
 
153 aa  67.4  6e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  32.14 
 
 
149 aa  67.4  6e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  66.2  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  29.86 
 
 
151 aa  66.2  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  30.46 
 
 
156 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  34.67 
 
 
152 aa  63.9  7e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  32.54 
 
 
143 aa  61.2  4e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  33.86 
 
 
138 aa  60.5  8e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  27.66 
 
 
152 aa  57.4  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  25.68 
 
 
151 aa  55.8  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  31.5 
 
 
144 aa  55.5  2e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  55.5  3e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  30.08 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  27.1 
 
 
157 aa  53.9  7e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  27.21 
 
 
154 aa  52.8  1e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
144 aa  48.9  3e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  47.8  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  28.77 
 
 
150 aa  47.4  7e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  26.17 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  26.81 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  27.54 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  26.47 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.64 
 
 
151 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  27.4 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  24.65 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  32.69 
 
 
455 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  25.16 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  24.65 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  27.81 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  30.59 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  25.52 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>