More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02674 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02674  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
327 aa  675    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  33.78 
 
 
306 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  37.32 
 
 
288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  37.2 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  38.92 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  37.2 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  38.16 
 
 
279 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  38.16 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  37.56 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  38.57 
 
 
277 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  37.68 
 
 
277 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  37.56 
 
 
286 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
282 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
281 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  39.13 
 
 
279 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 
297 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  37.2 
 
 
287 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  36.59 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  34.98 
 
 
280 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  30.45 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  35.1 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  36.1 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  35.58 
 
 
283 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  37.02 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  36.59 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  35.1 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  36.06 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  35.12 
 
 
279 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  30.24 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  28.87 
 
 
297 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.62 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  29.37 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  30.32 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  30.04 
 
 
289 aa  113  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.82 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  32.21 
 
 
273 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 
298 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  31.02 
 
 
296 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  28.47 
 
 
298 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 
298 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  33.48 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  33.02 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.29 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  29.29 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
355 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  30.41 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  29.23 
 
 
304 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  30.33 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  28.37 
 
 
305 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  33.81 
 
 
297 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  26.99 
 
 
305 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  33.17 
 
 
283 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  33.18 
 
 
340 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  32.71 
 
 
286 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0089  Rhodanese domain protein  31.42 
 
 
324 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000095367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
281 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  35.07 
 
 
308 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  31.16 
 
 
285 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  30 
 
 
289 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
290 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 
281 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0072  Rhodanese domain protein  31.34 
 
 
324 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.77875e-30 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  30.66 
 
 
293 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.88 
 
 
285 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1836  Rhodanese domain protein  29.1 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.98 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.98 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  28.64 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.91 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.33 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  33.17 
 
 
278 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.52 
 
 
289 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  31.22 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>