More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001615 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  97 
 
 
267 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  86.84 
 
 
267 aa  470  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.27 
 
 
267 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  65.91 
 
 
266 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  64.77 
 
 
266 aa  342  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.64 
 
 
266 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.26 
 
 
266 aa  334  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.78 
 
 
266 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.5 
 
 
266 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.65 
 
 
266 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.51 
 
 
266 aa  325  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.12 
 
 
266 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.87 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.66 
 
 
266 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  60.61 
 
 
267 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.08 
 
 
265 aa  290  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.68 
 
 
265 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.35 
 
 
272 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.77 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.47 
 
 
266 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.03 
 
 
266 aa  275  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  55.34 
 
 
266 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.08 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.32 
 
 
264 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.7 
 
 
265 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.01 
 
 
265 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  48.43 
 
 
270 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.3 
 
 
282 aa  205  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  44.83 
 
 
279 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  42.16 
 
 
269 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.48 
 
 
283 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
282 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  42.91 
 
 
269 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.54 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  38.85 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.02 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  38.95 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.65 
 
 
282 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  41.35 
 
 
265 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
282 aa  188  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  43.85 
 
 
270 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.89 
 
 
277 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
286 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  39.1 
 
 
285 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
292 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
282 aa  184  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  42.08 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.31 
 
 
276 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  41.25 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  40.07 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  42.19 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  40.22 
 
 
268 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  41.15 
 
 
262 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  39.53 
 
 
272 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  41.35 
 
 
290 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
267 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.77 
 
 
286 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  38.89 
 
 
272 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  41.13 
 
 
272 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  39.46 
 
 
386 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  42.86 
 
 
272 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  37.68 
 
 
281 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  40.31 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  43.23 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  38.52 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  43.23 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  38.91 
 
 
274 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.9 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  40.64 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.17 
 
 
294 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
282 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  39.18 
 
 
264 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  38.64 
 
 
273 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
277 aa  168  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  38.29 
 
 
300 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  35.56 
 
 
290 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  37.36 
 
 
290 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  40.07 
 
 
322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  40.07 
 
 
322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  40.15 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  36.46 
 
 
281 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  39.85 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.84 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  36.02 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  40.07 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
283 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  37.36 
 
 
302 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.36 
 
 
270 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.74 
 
 
280 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>